我院临床科室设有VIP特诊中心、牙体牙髓科（口腔黏膜科）、牙周科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科、儿童口腔科、口腔预防科、口腔种植科等科室。部分专科诊疗技术和水平在省内处于领先水平，国内有一定影响力。
当前，医院在临床科室建设方面已形成成熟完善的医疗架构体系：
VIP特诊中心
VIP特诊中心是我院服务品牌特色科室，秉承“公立医院技术，私立医院服务”的理念，主打“服务”牌。中心由具有良好医疗服务意识、高超专业技术水平、丰富口腔综合处理经验的高年资医师团队组成。中心环境优雅，服务温馨，诊疗空间独立，有效保护患者隐私，配备国际先进的牙科设备，为患者提供口腔临床医疗高新技术服务，诊疗项目涵盖牙体牙髓、修复、牙周、粘膜、种植、口外、正畸等专业，致力打造便捷的“一站式”口腔医疗服务。
牙体牙髓科
牙体牙髓科是浙南地区专门从事牙体牙髓疾病医疗、教学和科研的专业临床科室，拥有现代化牙科综合治疗椅35台，现有医师41人，科室日均门诊量为200余人，科室全面开展预约就诊的诊疗制度，为患者提供便利的、高效的医疗服务。科室引进大量先进仪器设备，开展的特色诊疗项目包括SonicFill超声大块树脂美学修复、微创渗透树脂技术、显微根管治疗和显微根尖外科手术等，处于省内领先水平。
牙周科
牙周科是治疗口腔中各种牙周组织疾病的专业科室。科室承担牙龈炎、牙周炎、牙龈退缩、牙周-牙髓联合病变、反映全身疾病的牙周炎及牙周炎联合修复、正畸、种植等疾病的诊疗。科室业务包括：龈下刮治术、根面平整术、松牙固定术、牙龈切除术、翻瓣术、引导组织再生术、牙冠延长术及治疗牙龈退缩的美容性手术治疗。
儿童口腔科
儿童口腔科是浙江省最早从事儿童口腔疾病预防、保健和诊疗的专业临床科室之一。开展儿童蛀牙、牙痛、牙髓根尖周病诊治；乳牙预成冠及透明冠修复；儿童牙外伤序列治疗；双排牙、多生牙等牙齿发育异常诊治；唇舌系带异常；儿童咬合异常的早期干预以及特殊儿童口腔疾患的诊治等。
口腔正畸科
口腔正畸科是浙江省最早开展口腔正畸工作的专业科室之一。应用了自锁托槽、舌侧矫治、隐形矫治和种植体支抗等先进临床治疗技术。除常规的正畸治疗外，还开展了儿童早期矫治、唇腭裂序列治疗、正畸-外科、正畸-修复、正畸-牙周等多学科联合治疗。
口腔修复科
口腔修复科是针对牙体（或牙列）缺损、牙列缺失及颌面部缺损进行专业诊断、治疗的科室。科室诊疗内容涵盖各类口腔修复疾病，包括牙体及牙列缺损、牙列缺失、美学修复、咬合紊乱、颞颌关节病等口腔疾患。治疗手段涉及活动义齿、固定义齿、种植修复、精密附着体义齿、合垫等多种方式。多人在全国及省级美学病例比赛中获奖，多次获省级科技奖励。
口腔种植科
口腔种植科是专门从事口腔种植临床工作的专业化科室。科室形成依托数字化技术的精准种植手术、个性化种植修复为方向的专业特色，在浙南地区完成首例穿颧种植手术，多人次在全国口腔种植修复病例比赛中获奖。
口腔颌面外科
口腔颌面外科是浙南地区规模最大的口腔颌面外科专业临床科室之一。在颌面部畸形的正颌外科整复、唇腭裂的综合序列治疗、危重颅颌面外科的急救与创伤修复、口腔颌面部恶性肿瘤的根治性手术、颞下颌关节疾病诊治等方面具有较高的学术造诣和技术水平。率先在温州地区开展了口腔颌面部畸形的正颌外科整复，颌面部创伤的急救处理与颌面部复杂骨折的综合治疗等方面达到了国内先进水平。
口腔预防科
口腔预防科是集儿童口腔疾病预防、保健和诊疗于一体专业化科室，有主任医师1名，主治医师4名，开展儿童龋齿的预防和治疗，龋病风险评估及口腔健康管理，儿童疑难牙髓和根尖周疾病的诊治，激光唇舌系带矫正，多生牙微创拔除，复杂牙外伤的序列治疗，早期错颌畸形如地包天，龅牙，下巴后缩及间隙丧失的早期干预。科室承担温州市皓齿工程任务，多人荣获省级、国家级荣誉，在省级国家级预防专业委员会担任学术职务。
医疗布局不断完善
医疗管理日趋科学
完成“1+2+N”的市域医疗布局。“1”指的是以龙湾总院为中心，设有10个临床科室，除了义齿制作中心、消毒供应中心等口腔专科医院特有的医技医辅科室，还按照三级甲等口腔专科医院标准，建设了相应的医技医辅科室；“2”指的是学院路院区与广场路院区，其中学院路院区以成人口腔综合门诊为主，广场路院区以儿童及青少年口腔疾病诊疗与牙齿矫治为主；“N”指的是分布在市区各域方便群众就近就医的独立开设或合作式特色门诊。
连续多年实施医疗质量安全提升工程。针对口腔专科医院“大门诊、小病房”的特点，制定符合口腔专科特点的医疗质量和安全的表单式指标管理体系，对全院门诊、病房、手术麻醉、医技等科室实施质量安全的全过程管理和精细化管理。坚持以患者为中心，持续提升医院服务能力，全面常规开放周末及节假日门诊，充分利用信息技术等手段持续优化就医流程，实施门诊就诊全预约，开设一站式服务中心，方便群众就医 “最多跑一次”，患者就诊满意度达 98%以上。
学界影响日益增强
医疗技术设备行业领先
医院在一大批临床专科学科带头人引领下，极大地提升了医院的行业影响力。
临床专科学科带头人
麻健丰
中华口腔医学会第六届理事会理事
