导读
【行业分析】基因测序系列，将聚焦基因测序设备，系统分析一代、二代、三代基因测序设备的技术原理，代表厂家，仪器特点以及未来趋势。本篇从技术原理、产品特点、公司现状、市场等方面，深入分析二代测序的三大代表技术：Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa，Hiseq技术和ABI公司的Solid技术。
Roche公司454技术
1、技术原理
Roche 454测序系统是第一个商业化运营二代测序技术的平台。它的主要测序原理如下图 abc所示。
illumina公司Solexa，Hiseq技术
技术原理
ABI公司Solid技术
技术平台对比及产品市场表现
技术平台
特点
Ro c h e / 4 54测序技术
1、454平台的突出优势是读长，每轮测序能产生100万个读长片段，读长可达到400-500bp；
2、主要的错误来自于同聚物，即相同碱基的连续延伸
3、读出的片段较短，而且不能提供配对端点测序信息；
I l l u m i n a / s o l e x a测序技术
1、每张测序芯片有8个通道，每个通道可单独运行一个样品，也可以把多个样品混合在一起检测;
2、一次实验可读取大于15亿个碱基/芯片;
3、可精确读取重复序列如:AAAAAAAAAAAAAAAAA,TTTTTTTTTTTTT;
4、实验费用低，测序成本为传统测序方法的 1/100;
5、应用范围极广，几乎囊括了目前基因组研究的所有方法
6、扩增是容易引入孔增错误积累，导致测序精确度降低。
A B I/ s o L iD技术
1、SOLiD 测序平台准确度能够达到99.94%，在片段覆盖率为15×时，测序准确度可接近100%。
2、该技术的读长在2×50bp，可读取序列较短，后续序列拼接同样比较复杂。
3、荧光解码阶段，鉴于其是双碱基确定一个荧光信号，因而一旦发生错误就容易产生连锁的解码错误。
【4】Mardis E R . Next-Generation DNA Sequencing Methods[J]. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 2008, 9(1):387-402.
作者声明：感谢本文参考资料作者，文中观点仅供参考，不恰当之处还望包涵指正。
作者：俞利平
审核：李芳
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