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除了统计图表之外，显微照片也是文章中必不可少的实验结果呈现方式。除了常规实验的各种组织切片照片，在空间转录组文章中显微照片更是常见，如下图。
（ Nature immunology , 2021）
（ Nature Communications , 2021）
（ Nature Communications , 2021）
通过观察以上案例可以发现，显微照片的呈现方式也是有讲究的，比如对照片的局部区域进行裁剪放大、在照片上添加ROIs (regions of interest) 或Overlays, 如矩形、箭头、文本标签、标尺等。
一般而言，对于位图的处理需要使用专门的位图编辑软件，比如Image J、Photoshop等，不过对于科研照片，我们被允许做的处理很有限，一般来说使用PPT、Ai (Adobe illustrator) 就够了。下面就为大家演示如何使用Ai实现第3个案例的效果。
图形置入
首先，打开Ai软件，点新建按钮创建10*10cm的文档，颜色模式我这里改为RGB，其他设置保持默认。
接着通过快捷键“Ctrl+R”调出标尺，使用小黑工具（选择工具）分别从左、上标尺上拖出垂直和水平参考线，如下图。
然后通过文件菜单下的“置入”命令，一次性将4张显微照片置入到当前画板中。
注意，这里按住Shift键可以“连选”照片，一次性全部置入。我这里以链接的方式置入到Ai中，当然你也可以取消勾选链接，以嵌入的方式置入照片。
将照片逐一置于画板的四个区域，适当调整图片的大小并相互对齐，如下。
裁切区域
接着新建一个图层，把其他的图层锁定后选中新图层，接下来主要在新图层中添加图形和文字。
使用矩形工具沿着“局部”图的边缘绘制矩形，然后缩小并移动矩形到左边的“全局”图上，根据图像特征（比如斑点的位置）确定矩形框的位置和大小。
通过反推的方式可大致找出对应的区域，如下。当然也可以调低顶层图像的透明度，不断调整大小和移动位置，直到找到完全叠合的区域。
接下来使用直线段工具绘制连线，如下。
选中矩形框和两条直线段，点击“描边”，在描边选项中勾选“虚线”，设置虚线和间隙的大小都为1pt，如下。
同样的方法，为另一组照片添加虚线框，我这里将虚线的颜色改为了黑色，确保与文献案例的效果一致。
添加标记
继续使用直线段工具绘制“箭头”，直线段的颜色设为白色，在“描边”选项中设置箭头的样式和大小。
接着，使用文字工具添加文字标签，字体样式这里选择Arial，大小为12pt，字体选择Italic（斜体），同样的方法，完成其他字体的添加。字体的角度可使用小黑工具配合Shift键进行旋转。
添加完文字之后，按住Shift键使用矩形工具绘制小正方形，然后按住Alt键用小黑工具移动正方形快速复制出3个，修改正方形的颜色和位置。最后，使用画板工具调整画板的大小，使组合图的边距看着舒服即可。
最终的效果如下：
当然，如果想把一张照片的局部放大也是可以的。先绘制矩形区域，然后按住Alt键用小黑工具同时移动照片和矩形快速复制出一份，框选第2份的矩形和照片，右键，执行建立剪切蒙版命令，即可将感兴趣的区域截出。
剪切后的效果如下，我们可以放大截出的图片。注意，如果想为截出的图片添加标尺，可以在放大前使用直线段工具和文字工具添加，线段的长度和单位可按照原图的标尺进行换算，之后再将添加的标尺和图片进行组合，一起放大。
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参考文献
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Ma F, Hughes TK, Teles R, et al. The cellular architecture of the antimicrobial response network in human leprosy granulomas[J]. Nature immunology, 2021, 22(7): 839-850.
Andersson A, Larsson L, Stenbeck L, et al. Spatial deconvolution of HER2-positive breast cancer delineates tumor-associated cell type interactions[J]. Nature Communications, 2021, 12(1): 1-14.
Joglekar A, Prjibelski A, Mahfouz A, et al. A spatially resolved brain region-and cell type-specific isoform atlas of the postnatal mouse brain[J]. Nature Communications, 2021, 12(1): 1-16.
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